مرکز تحقیقات فرهنگ و تمدن خلیج فارس در پی تایید و تصویب دبیرخانه اتحادیه دانشگاه‌های حوزه خلیج فارس که به تایید معاونت بین‌الملل دانشگاه آزاد اسلامی رسیده است به دانشگاه آزاد اسلامی واحد بوشهر ابلاغ شد و از آنجا که یکی از بندهای آن، راه‌اندازی مرکز تحقیقات فرهنگ و تمدن خلیج فارس بود با توجه به تاکید رئیس وقت واحد بوشهر، بهمن ۱۳۹۹ و با توجه به اهمیت، ضرورت و توجه به مبحث مطالعات خلیج فارس و اهمیت خلیج فارس برای ایران و جهان و دانشگاه آزاد اسلامی، طرح و پورپوزال راه‌اندازی فرهنگ و تمدن خلیج فارس توسط این‌جانب تدوین و در جلسه رسمی در حضور مدیرکل آزمایشگاه‌ها و مراکز تحقیقات دانشگاه آزاد اسلامی از آن دفاع شد و اسفند ۹۹ مورد تایید سازمان مرکزی دانشگاه واقع شد؛ فعالیت این مرکز تحقیقات از اواسط اردیبهشت ۱۴۰۰ و همزمان با روز ملی خلیج فارس با سخنرانی عبدالکریم مشایخی رئیس مرکز ایرانشناسی (شعبه بوشهر) آغاز شد.